結論？

万能のプロトコルなんざあるわけないんで、ケースによって使い分けるなり、最後の手段としてはネットワーク管理者と相談するなりしてね、ということになっちゃいます。
でも、そこにいたるまでの道具立てとしては、WebDAVがあってもいいんじゃないのかな？というのがオレの意見だったりします。