SoftEther 2.0の詳細を読んだ

送信パケットに対するニセの応答を返すことで（どこで返すかは忘れました…また記事読み返さなきゃ）、レスポンスを高速にするというような記述があったような気が。
あと、TCP over TCP の問題点は、スタックのタイマをいじることで改善している。下位レイヤでのパケット欠損による再送発生は避けられないものの、タイムアウトに起因する輻輳は改善されるだろう。
ただ1点心配なのは、前者の方法がどこかで特許申請されている可能性（というか危険性）があること。
杞憂に終わればいいけど…。